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日本免疫治療:基于變形菌基因組學的HLA提示新生抗原解析

時間: 2024-10-17 10:36 來源: 免疫密碼

札幌醫科大學病理學 金關貴幸

癌癥患者的T細胞通過包括突變氨基酸的HLA提示的新生抗原,有退去惡性腫瘤的效果。新生抗原將作為治療標的物,或者說是標志物被運用到癌癥治療中,多數癌細胞基因突變是患者個體獨有的變異,必須用個性化的方法提供免疫治療。眾所周知,最新的檢查方法可以更廣發的檢索體細胞基因突變,但是現在的測序手段卻很正確的選擇被HLA提示的氨基酸突變。目前迫切需要解析的是如何選擇新生抗原的肽鏈,HLA可以提示什么部位的突變才能誘導T細胞發揮強力的抗癌效果。

我們直接提取了HLA的結合肽抗原,全面解讀并確定了變形菌基因的解析方法。結合細胞特有的基因突變信息,可自然檢驗出HLA提示的新生抗原。先分析結直腸癌HLA-1提示的整體肽鏈目錄,新生抗原所占的比例非常有限。推測被HLA提示的突變氨基酸相當于每個HLA烯丙基錯義突變全體的0.1%,顯示了新生抗原的稀缺性。

在基因突變較多的MSI型結直腸癌細胞中可以檢測出多個新表位。其中一個為9-mer,在P8上有突變氨基酸(Asn>Lys)。用同樣的肽鏈誘導CTL識別其中的1個氨基酸突變,CTL可以對該基因突變的結直腸癌細胞進行強力傷害。3D成像該肽鏈-HLA的復合體模型,觀察到TCR的立體構造發生變化,我們認為它特異性地T細胞識別和抗原獲取造成了突變的構造變化。

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